83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2266 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  56.52 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  53.33 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  52.63 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  50.82 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4244  protein of unknown function DUF397  36.22 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  57.69 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  52.63 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  53.57 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  50.88 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  54.24 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  52.54 
 
 		 63 aa  51.2  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  54.55 
 
 		 67 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  51.72 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  51.72 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 64 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  43.28 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  48.21 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  47.37 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  48.28 
 
 		 62 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  50.88 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.21 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  51.72 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  50.82 
 
 		 75 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  56.86 
 
 		 66 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  51.92 
 
 		 68 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  64.71 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  41.79 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  64.71 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  46.43 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  45.1 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  43.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  45.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  47.06 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  51.79 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  44.62 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  46.03 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  50.94 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  44.93 
 
 		 75 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  45.76 
 
 		 80 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  51.79 
 
 		 73 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  51.79 
 
 		 73 aa  43.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 70 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  41.51 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  41.18 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48.08 
 
 		 69 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 84 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  44.64 
 
 		 65 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  43.08 
 
 		 67 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  52.27 
 
 		 67 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  38.36 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 63 aa  41.6  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  55.88 
 
 		 76 aa  41.2  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  41.51 
 
 		 64 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  45.28 
 
 		 78 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  55.88 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  41.86 
 
 		 80 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>