52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5037 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 73 aa  143  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.48 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  42.19 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.78 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  40.28 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  37.88 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  39.47 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  38.67 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  40.58 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  41.54 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  43.24 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  34.72 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  44.62 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  36.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  40.91 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  41.89 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  40.85 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  40.28 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  43.94 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  35.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  33.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  35.14 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  39.24 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  37.31 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  34.33 
 
 		 79 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  42.47 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  32.35 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  39.39 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  42.65 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  35.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  38.71 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  34.72 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  38.46 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  39.73 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  36.11 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  42.03 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  37.84 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  46.97 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  38.1 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  39.71 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  40.91 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>