47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0417 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
63 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  55.74 
 
 
63 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  54.1 
 
 
64 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  43.1 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  44.64 
 
 
69 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  39.66 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  47.37 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  57.89 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.44 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  42.22 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  45.16 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  40.82 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
60 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  41.07 
 
 
68 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  48.21 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  46.3 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  37.04 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  36.67 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  43.64 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  37.04 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  47.27 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  42.59 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  41.07 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  35.19 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  42.59 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.86 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  35.09 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  40.74 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  39.34 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  44.74 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  41.94 
 
 
68 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>