48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1596 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  51.85 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  56 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  48.28 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  45.76 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  44.83 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.44 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  39.39 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  43.1 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  47.83 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  41.07 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  43.94 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  46.03 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.75 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  39.68 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.67 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  42.22 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.83 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 410 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  37.25 
 
 		 64 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  43.08 
 
 		 69 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  45.83 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  35.38 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  36.92 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  39.39 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  39.29 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  42.86 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.07 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  43.1 
 
 		 66 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>