53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4271 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
73 aa  153  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  53.33 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  38.89 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  44.62 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  45.61 
 
 
67 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.94 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  43.94 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  38.98 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  37.1 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  42.37 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  35.48 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  41.07 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  36.76 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  38.33 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  37.29 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  35.29 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  37.31 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  38.33 
 
 
82 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  35.48 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  35.59 
 
 
61 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  42.31 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  38.33 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  36.21 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  31.15 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  33.82 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  36.07 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  38.71 
 
 
63 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  33.33 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.7 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  32.79 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  35.48 
 
 
92 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  41.07 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>