141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0397 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  64.71 
 
 
68 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  59.7 
 
 
77 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  58.21 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  53.73 
 
 
77 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  59.7 
 
 
67 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  58.06 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  66.67 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  65.52 
 
 
69 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  52.24 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  55.93 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  56.25 
 
 
78 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  64.29 
 
 
62 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  59.38 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  46.27 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  47.76 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  52 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  55.07 
 
 
69 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  53.73 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  47.76 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  60 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  59.38 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  55 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  60.66 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  49.28 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  58.93 
 
 
62 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  47.76 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  52.24 
 
 
69 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  58.18 
 
 
68 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  48.39 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  64.29 
 
 
63 aa  60.1  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  41.79 
 
 
77 aa  59.3  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  49.21 
 
 
92 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  62.5 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  48.44 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  52.31 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  48.44 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  57.38 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  45 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  54.69 
 
 
67 aa  57.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  50.77 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  50.79 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  54.1 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 
61 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  56.36 
 
 
61 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  60.71 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  50.79 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  55.17 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  58.93 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  54.1 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
69 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  42.86 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  55.36 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  47.3 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  49.21 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  46.03 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  49.15 
 
 
66 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.03 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.15 
 
 
67 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  43.55 
 
 
62 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  53.57 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  53.85 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  50.88 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  41.67 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  48.21 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  45.31 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  46.88 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  46.88 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 
410 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  43.66 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  43.1 
 
 
61 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  45.61 
 
 
66 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  50.98 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  41.07 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  39.13 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4244  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.258284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  39.13 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>