181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7763 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  71.67 
 
 
64 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  73.21 
 
 
63 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  68.85 
 
 
63 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  70.18 
 
 
62 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  73.21 
 
 
63 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  69.64 
 
 
62 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  72.73 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  73.21 
 
 
63 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  67.21 
 
 
63 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  63.33 
 
 
62 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  66.07 
 
 
63 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  69.64 
 
 
63 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  69.64 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  57.14 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  70.91 
 
 
62 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  64.18 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  60.71 
 
 
63 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  65.62 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  66.67 
 
 
62 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  65.45 
 
 
61 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  61.76 
 
 
67 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  67.27 
 
 
62 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  62.12 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  60.71 
 
 
62 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  55.84 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  63.16 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  62.3 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  58.46 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  57.14 
 
 
62 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  62.26 
 
 
62 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  59.26 
 
 
60 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  61.9 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  55.38 
 
 
69 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  60.34 
 
 
69 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  50.77 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  53.03 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  55.38 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  59.09 
 
 
69 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  55.56 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  52.31 
 
 
73 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  59.38 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  53.57 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  56.92 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  46.48 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  51.56 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  51.56 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  57.89 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  54.1 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  55.22 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  53.97 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  53.97 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  55.17 
 
 
68 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  52.31 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  52.31 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  46.88 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  53.33 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  54.55 
 
 
62 aa  60.8  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  48.48 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  53.23 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  50.79 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  59.26 
 
 
66 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  58.62 
 
 
68 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  46.88 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  51.56 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  53.45 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  44.62 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  44.62 
 
 
71 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  55.36 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  55.74 
 
 
67 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  45.31 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 
64 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  49.21 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 
83 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  49.18 
 
 
69 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  51.67 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  48.44 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  51.72 
 
 
61 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  41.54 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  41.54 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0425  hypothetical protein  52.46 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  55.56 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  45.31 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  46.97 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>