153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1329 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  66.67 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  58.82 
 
 		 69 aa  84.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  64.71 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  64.18 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  60.61 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  61.02 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  58.33 
 
 		 80 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  53.33 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  66.67 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  53.25 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  57.38 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  54.69 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  57.38 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  48.48 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  56.36 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  51.9 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  55.74 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  55.74 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  50.77 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  52.73 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  52.73 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  50.79 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  51.79 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  51.72 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  60.71 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  61.11 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  50.77 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  48.48 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  65.45 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  57.89 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  55.36 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  58.18 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  58.93 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  47.3 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.03 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  55.56 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  43.08 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  49.18 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  58.93 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  58.93 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  58.93 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  58.93 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  40.62 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  52.46 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  57.14 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  49.15 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  53.57 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  52.73 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  45.9 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  43.94 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  48.48 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  45.16 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  49.12 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  51.79 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  46.27 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  48.44 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  43.55 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  50.77 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  46.15 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  52.08 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  54 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  41.94 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 		 410 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  41.54 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  48.39 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  48.28 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  41.82 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  43.48 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>