22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5761 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  42.03 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4271  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  44.07 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  42.11 
 
 
62 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  39.13 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  43.1 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  39.68 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  36.23 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  52.63 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  39.34 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  40.68 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  34.78 
 
 
73 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  38.98 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  55.26 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  39.39 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>