31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1942 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
64 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
92 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  37.29 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
75 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  35.59 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  38.18 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  37.93 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  36.21 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  43.33 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.28 
 
 
61 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  42.86 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  38.98 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  34.48 
 
 
65 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  40 
 
 
78 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  37.1 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  38.89 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  39.34 
 
 
71 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  36.54 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  34.55 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  43.64 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>