84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2538 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
62 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  69.35 
 
 
65 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  77.78 
 
 
63 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  73.21 
 
 
60 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  70.18 
 
 
60 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  69.81 
 
 
63 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  62.26 
 
 
63 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  62.07 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  57.38 
 
 
64 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  60.34 
 
 
63 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  56.9 
 
 
61 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  58.18 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  56.36 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  61.54 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  60 
 
 
62 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  51.67 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
60 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  57.14 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  58 
 
 
62 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
57 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  54.9 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
63 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  52.08 
 
 
55 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
58 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 
56 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  40.74 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  46.43 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  49.09 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.28 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  68.75 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
59 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  48.08 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
82 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  43.4 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  43.4 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  46.3 
 
 
64 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  44.83 
 
 
64 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  45.83 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
61 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  54.29 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
62 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  44.64 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  54.55 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  58.33 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
68 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  39.22 
 
 
78 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  57.58 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  41.51 
 
 
63 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1942  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00943958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  42.31 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5406  hypothetical protein  43.86 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.502817 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  57.58 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>