91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5406 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5406  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.502817 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
62 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
62 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
59 aa  50.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
60 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.07 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  47.46 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
66 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  43.4 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  43.1 
 
 
75 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  38.71 
 
 
80 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  51.79 
 
 
72 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  41.38 
 
 
76 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  38.98 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  51.61 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.28 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  45 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  38.1 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  38.33 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  41.38 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.1 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  41.67 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  34.92 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  42.86 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.1 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.07 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  46 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  43.86 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  43.94 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  43.1 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  42.37 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  42.59 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  39.66 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  39.34 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  48.15 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  39.34 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  42.59 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  37.1 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  30.12 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  44.26 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  35.85 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0372  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  34.43 
 
 
66 aa  40.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 
59 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>