23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4318 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  47.56 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4752  hypothetical protein  55.17 
 
 		 57 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.049754  normal  0.080788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1378  hypothetical protein  52.73 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2092  hypothetical protein  61.9 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.406481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  43.33 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0083  hypothetical protein  51.35 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  46.55 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  34.25 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4906  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  46.27 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 		 410 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 70 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  49.18 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  48.15 
 
 		 75 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  44.83 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  40.26 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 72 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  47.37 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>