18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4752 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4752  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.049754  normal  0.080788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  55.17 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1378  hypothetical protein  55.36 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2092  hypothetical protein  62.79 
 
 		 57 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.406481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0083  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4906  hypothetical protein  51.79 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.28 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  43.1 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  43.64 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  45.45 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  48.15 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.3 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 65 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.44 
 
 		 64 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 		 59 aa  40  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  42.59 
 
 		 72 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>