41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1471 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  45.71 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  45.31 
 
 
62 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  46.55 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  45 
 
 
410 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4752  hypothetical protein  43.1 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.049754  normal  0.080788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  49.18 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  42.19 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  47.37 
 
 
75 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  46.15 
 
 
62 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5761  hypothetical protein  43.1 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736194  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  41.94 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  44.07 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  41.94 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  44.78 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  41.27 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  45 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  39.68 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  43.48 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0083  hypothetical protein  43.33 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  40.68 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  36.92 
 
 
73 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.75 
 
 
68 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  38.33 
 
 
61 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  43.94 
 
 
61 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2092  hypothetical protein  42.22 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.406481  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  42.03 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  39.06 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>