92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5086 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  87.01 
 
 
77 aa  133  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  71.43 
 
 
77 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  50.75 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  56.67 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  56.67 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50.82 
 
 
69 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  47.54 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  49.18 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  55.56 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  43.08 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  44.29 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  45.31 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  42.25 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  46.27 
 
 
67 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  40.85 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  46.03 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  46.27 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  43.24 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  38.46 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  51.85 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  42.47 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  42.42 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  45.76 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  48.15 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  46.55 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  46.55 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  49.12 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  42.11 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  50.98 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  47.27 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  41.94 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.42 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  49.06 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  49.09 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  34.85 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  47.06 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
65 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
61 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  47.06 
 
 
60 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  47.06 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  38.81 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  36.99 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  48.28 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  40.98 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  36.54 
 
 
64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  47.06 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  41.67 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  44.44 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  38.71 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  46.81 
 
 
73 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
59 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  33.82 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  46.67 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
78 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  35.59 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  42.19 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.07 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  43.86 
 
 
69 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  39.44 
 
 
69 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  37.7 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  37.25 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  35.62 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  40 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  41.07 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
59 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  42.62 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  35.09 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  44.83 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>