77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3763 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
83 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  68.12 
 
 
71 aa  99.8  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  69.12 
 
 
71 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  50.75 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  49.23 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  52.38 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  42.31 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  52.46 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  52.31 
 
 
92 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  40 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  47.83 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  38.75 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  44.12 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  40.26 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  44.26 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.33 
 
 
68 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.67 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  41.89 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  40.51 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  45.16 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  37.84 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  37.66 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  38.96 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  37.66 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  47.06 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  40.91 
 
 
69 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  47.54 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  43.28 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  35.06 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.26 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  41.43 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  37.31 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  38.67 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  46.77 
 
 
65 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  54.29 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  35.9 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  52.5 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  33.7 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  41.54 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  43.55 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  42.65 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  41.18 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  41.27 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  42.19 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  40.91 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  31.51 
 
 
77 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  43.64 
 
 
67 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  47.37 
 
 
85 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  39.68 
 
 
69 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  36.51 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
61 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  43.24 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  38.33 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  43.24 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  36.23 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  28.57 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  37.84 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  35.94 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  36.51 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  46 
 
 
92 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.1 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  33.87 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  41.38 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  39.29 
 
 
61 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  35.48 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  42.65 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  41.18 
 
 
63 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>