92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0906 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  41.94 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  41.27 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  44.64 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  37.84 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  44.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  44.62 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  40.91 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  37.7 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  47.27 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  44.07 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  36 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  44 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  47.62 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  41.27 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 57 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  48.98 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  36.9 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  43.1 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  46.03 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  38.1 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  34.92 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  33.78 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  43.86 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  30.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  41.27 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  36.49 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  32.88 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  38 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  46.81 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1301  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0886559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  45.61 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  33.93 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  44.26 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  28 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  37.25 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  36.67 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  42 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  44.83 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  40.58 
 
 		 73 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  36.36 
 
 		 61 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  35 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0417  protein of unknown function DUF397  35.19 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  31.34 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  47.73 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40.62 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  43.64 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  41.38 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  44.83 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  43.4 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  52.63 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  32.81 
 
 		 70 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  33.78 
 
 		 80 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>