60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3929 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
57 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  60.38 
 
 
59 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  64.81 
 
 
57 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  66.67 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  63.46 
 
 
59 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  64 
 
 
55 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  60.38 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
57 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  52.83 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  56.86 
 
 
56 aa  57  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  54.72 
 
 
52 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
56 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  62.22 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  51.85 
 
 
60 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
63 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  48.15 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
63 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  53.19 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
60 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  44.44 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  45.45 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  44 
 
 
63 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  43.75 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  43.14 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  38.46 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  46.15 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  40.38 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  39.62 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
64 aa  43.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  42.55 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  36.54 
 
 
64 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  42.31 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  45.1 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  39.22 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  37.25 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  38.18 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.83 
 
 
80 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  35.19 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 
55 aa  40.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  36.54 
 
 
61 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 
61 aa  40.8  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  34.62 
 
 
127 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>