57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4489 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 59 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  58.7 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 52 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  48.15 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 56 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  47.17 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  46 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40.32 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  48.94 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 		 59 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  41.82 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  40.68 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.14 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  40.98 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  48.15 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  44.23 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  46.3 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  38.33 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  41.82 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  45.45 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  40.82 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  39.66 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  36.07 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  44 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  31.51 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  37.7 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  42.55 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 66 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>