49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5039 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
61 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  65.22 
 
 
52 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  60.42 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  55.36 
 
 
56 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  63.27 
 
 
62 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  55.1 
 
 
57 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 
60 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  60.47 
 
 
60 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  54.17 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
59 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  55.1 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
56 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
59 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  44.83 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  56.25 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  48 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  44 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  48 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4035  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
40 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  54.9 
 
 
59 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  48 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  46.94 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  53.19 
 
 
55 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  51.06 
 
 
57 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  54 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  47.92 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.08 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  41.18 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  43.14 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.94 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1943  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00825556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  43.75 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  46 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  44.9 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  44 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>