168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0708 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  67.19 
 
 		 64 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  65.45 
 
 		 61 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  64.81 
 
 		 82 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  65.38 
 
 		 79 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  66.04 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  56.9 
 
 		 67 aa  67  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  53.97 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  62.5 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  61.82 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  60 
 
 		 69 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  54.9 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  62 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  55.77 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 55 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  49.09 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  53.85 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  54 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  51.02 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  55.56 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  58 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  46.67 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  54.72 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  47.62 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  46.43 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  53.7 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  52.63 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  52.38 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  51.79 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  54.17 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  46.67 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  50.91 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  42.03 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  50.91 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  56 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  47.37 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 64 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 56 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  51.92 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  54 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  41.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  54 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  42.11 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  46.43 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  44.07 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  48 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  52 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  56.25 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  53.06 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  48.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  44.07 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  39.44 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  41.79 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  36.36 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  45.59 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  53.06 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  53.19 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  52 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  38.18 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>