120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0487 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
63 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  73.33 
 
 
63 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  73.77 
 
 
63 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  56.45 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  62.26 
 
 
62 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  63.83 
 
 
62 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
65 aa  70.5  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  59.65 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  58.18 
 
 
64 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  52.54 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 
60 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  54.39 
 
 
61 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  58.18 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  57.69 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  53.7 
 
 
60 aa  64.7  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 
66 aa  62.8  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  59.62 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 
66 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40.62 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  51.92 
 
 
63 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  44.07 
 
 
62 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  47.27 
 
 
63 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
57 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  49.12 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
62 aa  57.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  47.27 
 
 
63 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  45.76 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  49.09 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.07 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  44.44 
 
 
62 aa  53.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  38.33 
 
 
63 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  52.08 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
66 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  45.45 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 
62 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  39.66 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  38.6 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  53.19 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  46.55 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  41.82 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  46.15 
 
 
113 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  39.29 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  57.5 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  32.76 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  34.43 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  42.31 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  43.33 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  42.59 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  38.71 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  37.5 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  52.17 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  42.11 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  43.64 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  45.1 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
59 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  43.86 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  53.66 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  35.59 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  47.73 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0372  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  35.09 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  60 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0083  hypothetical protein  46.55 
 
 
79 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  51.28 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
52 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  30.56 
 
 
80 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  33.33 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  37.29 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  31.03 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  37.93 
 
 
62 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>