63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4682 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
63 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  59.26 
 
 
59 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  52.73 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  54.55 
 
 
56 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  52.83 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
59 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
60 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
60 aa  61.6  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  55.36 
 
 
63 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  54.24 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 
60 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  54.1 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  56.86 
 
 
55 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
56 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
63 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  54.72 
 
 
57 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
79 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  51.72 
 
 
81 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
62 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  47.46 
 
 
59 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 
55 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
57 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  53.7 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  53.85 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  52.08 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  62.22 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
58 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  51.79 
 
 
79 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  55.36 
 
 
63 aa  50.4  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  44.62 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  51.79 
 
 
73 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  47.37 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  47.46 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
52 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  45.9 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  51.28 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.39 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  40.74 
 
 
61 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  46.3 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  40.68 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  40.74 
 
 
83 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
61 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  51.35 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  46.15 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
75 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
64 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>