101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0393 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  130  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  56.6 
 
 		 62 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  55.36 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  51.72 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  59.65 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  53.57 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  59.18 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50.94 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 56 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  52.63 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  48.39 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  53.85 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  47.46 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 55 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  45.76 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 60 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 60 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  35 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  51.72 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.15 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  41.94 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  36.67 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  40.68 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  37.29 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  46.55 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 62 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  48.39 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  46.77 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  52.08 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.3 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  36.11 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  47.17 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  43.86 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  38.98 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  43.86 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  40.35 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.57 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  38.1 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  48.21 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  40.35 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  43.86 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  43.64 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 92 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4489  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  52.17 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  35.59 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  41.07 
 
 		 72 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  40.32 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  45 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  38.81 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.07 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  41.07 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>