92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6374 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  50.88 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  44.64 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 66 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  48 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  43.1 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  44.07 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  39.29 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  45.83 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  45.1 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  47.27 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  46.81 
 
 		 64 aa  47  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  39.66 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  41.07 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  38.33 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  38.33 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  35 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  40.82 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  39.62 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  37.7 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  43.86 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  45 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  41.07 
 
 		 63 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  40.74 
 
 		 62 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  39.06 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.23 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  44.44 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  44.68 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2429  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  42 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  40.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  42.31 
 
 		 69 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  40.74 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 64 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  38.98 
 
 		 62 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  48 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  36.92 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  45.28 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  42.31 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40.62 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  38.33 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  36.54 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  40.43 
 
 		 55 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 65 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>