69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5993 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 64 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  46.3 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  48.21 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  44.64 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  42.62 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  40.68 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  46.94 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40.58 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  43.64 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  44.9 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  46 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  37.29 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 61 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2429  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  42.59 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  40.74 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  44 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  38.89 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 127 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  43.64 
 
 		 68 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  42.31 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  34.92 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  37.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  34.21 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  39.62 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  41.07 
 
 		 80 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  34.62 
 
 		 64 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  37.93 
 
 		 68 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 		 79 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>