25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2429 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2429  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 61 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  42.62 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  49.09 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  40.68 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  40.98 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  44.64 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  43.86 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  41.38 
 
 		 68 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  37.7 
 
 		 67 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  44.68 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  45.28 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>