78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3501 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
79 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  75 
 
 
82 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  65.38 
 
 
64 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  60.38 
 
 
64 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  56.86 
 
 
61 aa  68.6  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  49.28 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  50.94 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  54 
 
 
63 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
63 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  51.02 
 
 
55 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  60.38 
 
 
69 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  55.36 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  53.57 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
61 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4784  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 
61 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  51.85 
 
 
62 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  40.91 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  54.55 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  49.02 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  40.85 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4088  protein of unknown function DUF397  59.46 
 
 
57 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
60 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  43.75 
 
 
79 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  53.85 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  44.9 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  49.06 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  48.98 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  45.28 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  32.89 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  52 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 
58 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  44.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  37.5 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  34.25 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4515  protein of unknown function DUF397  42.37 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  38.27 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5037  protein of unknown function DUF397  34.67 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  46 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  45.83 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 
57 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
57 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  39.58 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  47.37 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  52.94 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  40.28 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
62 aa  41.2  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  48 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  51.22 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  49.06 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  49.06 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  35.19 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
66 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  48.21 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  46.94 
 
 
68 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
64 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>