59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0215 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  66.04 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  64.15 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  50.91 
 
 		 62 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  52.54 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  48.15 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  56.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  51.85 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  53.7 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  51.85 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0393  hypothetical protein  57.89 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  49.02 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  49.09 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  43.1 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  52.83 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  49.09 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  48.08 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  42 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  50.94 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  43.14 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  46.15 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  53.06 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  51.02 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  50.98 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  43.48 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  43.4 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  49.02 
 
 		 69 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 		 55 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  47.37 
 
 		 64 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 60 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  46.94 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  49.02 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  41.07 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  44.64 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  47.92 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  36.84 
 
 		 65 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>