158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7828 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  58.82 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  53.73 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 
61 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  57.81 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  55.22 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.77 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  53.73 
 
 
69 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  49.21 
 
 
67 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  45.95 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  51.72 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  48.48 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  49.23 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  41.18 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  43.28 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  46.03 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  47.27 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  45.9 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  42.5 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  40.91 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  44.74 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  53.45 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  43.28 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  50.77 
 
 
73 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
69 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  50.91 
 
 
63 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  46.77 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  41.94 
 
 
73 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  50.91 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  49.15 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  50.77 
 
 
73 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  47.76 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  51.85 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  43.55 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  46.97 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  47.76 
 
 
139 aa  52  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  55.56 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  39.34 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  45.45 
 
 
66 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  43.75 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
64 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  40.3 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  54.55 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0967  putative regulator  35.38 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.783721  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  43.64 
 
 
61 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  45.45 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  49.15 
 
 
64 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  38.71 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  47.46 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  38.57 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  47.37 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  54.55 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  35.38 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  41.67 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  54.55 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  39.66 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  40.35 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  40.68 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  34.78 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  39.71 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  41.07 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  41.94 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  36.92 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  35.23 
 
 
110 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  39.71 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  46.55 
 
 
63 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  39.71 
 
 
99 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 
58 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  40.35 
 
 
65 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  35.29 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  43.28 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  52.73 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  50.91 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  36.92 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  38.33 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>