77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_12060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  100 
 
 		 65 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  78.79 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  76.12 
 
 		 64 aa  94  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  52.38 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  55.93 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  53.57 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  46.38 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  47.46 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  53.57 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  50.88 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  50.88 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  50.85 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  47.54 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  49.12 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  43.94 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  48.28 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  45.61 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  46.03 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  46.77 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  53.7 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  46 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.28 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  53.7 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  47.37 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  42.42 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  44.83 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  45.61 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  44.26 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  44.83 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  43.4 
 
 		 57 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  45.61 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  40.68 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  42.65 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  54.29 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  54.05 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.13 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  40.35 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  47.46 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  35.09 
 
 		 75 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  38.81 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  53.12 
 
 		 89 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  40.35 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  40.35 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0967  putative regulator  43.64 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.783721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  32.14 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  36.84 
 
 		 60 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>