51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1653 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
59 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  81.36 
 
 
59 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  51.79 
 
 
56 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  48.08 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 
63 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  53.7 
 
 
60 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  58.49 
 
 
57 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  57.14 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  59.18 
 
 
55 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
59 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  49.12 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  44.44 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  53.7 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
60 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  54.39 
 
 
56 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
57 aa  51.6  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  55.56 
 
 
52 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
59 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  46.15 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  56.52 
 
 
60 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
63 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  54 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  43.86 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
63 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4088  hypothetical protein  48.08 
 
 
57 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  46.3 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  47.06 
 
 
63 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  34.48 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  37.74 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
55 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  39.29 
 
 
59 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  40.38 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  35.85 
 
 
66 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  45.28 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0215  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 
59 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  41.51 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>