40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2580 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2580  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0232734 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5452  protein of unknown function DUF397  64.15 
 
 
59 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455168  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3929  protein of unknown function DUF397  63.46 
 
 
57 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  61.22 
 
 
58 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  60.42 
 
 
55 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  61.22 
 
 
57 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2768  protein of unknown function DUF397  55.77 
 
 
56 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141211  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2579  protein of unknown function DUF397  52.73 
 
 
57 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0222791 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2767  protein of unknown function DUF397  52.54 
 
 
60 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0824129  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5445  protein of unknown function DUF397  59.57 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.644753  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1652  protein of unknown function DUF397  54.72 
 
 
59 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0828203  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1653  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 
59 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1876  protein of unknown function DUF397  56.6 
 
 
56 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  50.98 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2308  protein of unknown function DUF397  54.9 
 
 
60 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  53.06 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4682  protein of unknown function DUF397  52.08 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  49.12 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  53.06 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  49.06 
 
 
60 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5039  protein of unknown function DUF397  45.61 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.23 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0091  hypothetical protein  44.68 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.407205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 
59 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 
55 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1875  protein of unknown function DUF397  45.83 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  46.81 
 
 
57 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1295  protein of unknown function DUF397  37.25 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  38.18 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  39.22 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  37.5 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  35.85 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3501  protein of unknown function DUF397  35.19 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  35.85 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>