80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0413 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5993  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  48.33 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.75 
 
 		 68 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  46.55 
 
 		 69 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  45.76 
 
 		 63 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  45.76 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  53.33 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  46.88 
 
 		 66 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  53.33 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  53.33 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  46.55 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  51.11 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  43.1 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  43.86 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  39.29 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  48.89 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  51.11 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  42.37 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.89 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  39.66 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0108  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  45.16 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  49.09 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  38.71 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  51.11 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  39.06 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  48.15 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  33.85 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  34.12 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  36.92 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  39.68 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  44.44 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  46.67 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  48.89 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  43.55 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  41.27 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  38.46 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  39.68 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  40.3 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  41.82 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  41.27 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  40.32 
 
 		 77 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 		 76 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  38.1 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  38.18 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4783  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  37.25 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  42.37 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  41.94 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  36.51 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  40.68 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  47.83 
 
 		 60 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>