102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4569 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4569  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4568  hypothetical protein  83.56 
 
 		 77 aa  118  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.246526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5086  hypothetical protein  71.43 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000003971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  42.31 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  49.23 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  49.23 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  52.38 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  53.33 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  51.43 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  58.18 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  53.45 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  49.23 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  46.48 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  49.21 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1745  hypothetical protein  49.15 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.64493  normal  0.800474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.15 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  47.69 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  50.82 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  51.72 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  47.54 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1728  hypothetical protein  54.24 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0749322  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  46.97 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  47.76 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  52.46 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  47.69 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  35.29 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.19 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0906  hypothetical protein  44.62 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  45.9 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  45.9 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  47.54 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  50.91 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  46.27 
 
 		 73 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  39.47 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  45.9 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  46.55 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  41.94 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  43.08 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  47.54 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  46.67 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4685  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.144765  normal  0.226614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40.62 
 
 		 65 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  44.64 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  44.62 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  44.62 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  47.62 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  46.43 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1802  hypothetical protein  42.62 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  45.9 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  39.06 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  44.64 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4869  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.940812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0972  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  46.3 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  38.98 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  39.71 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  43.28 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1657  hypothetical protein  36.51 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  46.15 
 
 		 57 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4378  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1471  hypothetical protein  43.48 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.394456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0262  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  47.46 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  47.37 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0413  protein of unknown function DUF397  40.32 
 
 		 68 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  37.31 
 
 		 103 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  40.98 
 
 		 80 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  42.62 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4272  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  34.67 
 
 		 77 aa  40.8  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  38.81 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  37.31 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0631  hypothetical protein  37.7 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.243928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>