17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4906 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4906  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4752  hypothetical protein  51.79 
 
 
57 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.049754  normal  0.080788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1378  hypothetical protein  55.17 
 
 
58 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4318  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  49.15 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5232  hypothetical protein  84 
 
 
79 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.664195  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0083  hypothetical protein  49.12 
 
 
79 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  45.76 
 
 
62 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  50.85 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
58 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.33 
 
 
68 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  47.46 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  48.33 
 
 
69 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  45.16 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>