32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  100 
 
 		 92 aa  187  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  55.95 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  42.11 
 
 		 106 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  47.3 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  45.33 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  42.67 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  47.3 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  45.07 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  43.24 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  43.42 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  45.71 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  39.19 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  42.25 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  40.28 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  41.77 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  39.73 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  40.28 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  40.85 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  46.94 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  46 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  56.76 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  43.75 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  36.62 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  37.31 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  42.42 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  36.11 
 
 		 82 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  51.43 
 
 		 83 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  34.21 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  37.33 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>