52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3784 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  58.46 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  70.59 
 
 
72 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  67.65 
 
 
72 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  53.66 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  56.76 
 
 
69 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  56.41 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  70.97 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  58.33 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  67.65 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  62.86 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  40.28 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  68.75 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  58.82 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  52.63 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  40 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  57.89 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  55.26 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  42.19 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  58.97 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.44 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  58.82 
 
 
77 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  47.37 
 
 
78 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  47.37 
 
 
83 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  58.97 
 
 
76 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  55.56 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  58.82 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  59.46 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  52.27 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  45.24 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  54.29 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  49.02 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  54.29 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  47.37 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  50 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  47.37 
 
 
71 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  50 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  56.76 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  40.48 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  52.38 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45.95 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  41.86 
 
 
79 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  44.74 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  48.57 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  58.82 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  39.22 
 
 
64 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  41.86 
 
 
79 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  34.92 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  40 
 
 
65 aa  40  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>