65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0787 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  48.61 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  42.11 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  42.47 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  34.78 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  46.15 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  40.62 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  35.94 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40.91 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  42.19 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  37.88 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  67.65 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  54.29 
 
 		 83 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  40.68 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  39.73 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  36.51 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  42.62 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  42.62 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  36.92 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  36.84 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  35.38 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  38.98 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  38.6 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  40.68 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  38.1 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  34.72 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  33.85 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  37.1 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  36.84 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5736  hypothetical protein  37.31 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.534328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  54.05 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  36.84 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  58.82 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  51.35 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  33.9 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3009  hypothetical protein  36.36 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  54.05 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  35.09 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  57.14 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  31.58 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  54.05 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  30 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  33.9 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  33.33 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  36.21 
 
 		 62 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  34.92 
 
 		 69 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  40.43 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  34.43 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  30 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  35.09 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  44.12 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>