22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0425 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0425  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  58.18 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  48.44 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  47  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  39.06 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  39.06 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  50.91 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  49.09 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  56.25 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  45.76 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  52 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  35.38 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1597  hypothetical protein  41.54 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4504  hypothetical protein  53.19 
 
 
62 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0265  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
68 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138869  normal  0.97902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4255  hypothetical protein  44.9 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.912797  normal  0.127607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  52 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  49.09 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  48.15 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  41.27 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>