28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4244 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4244  protein of unknown function DUF397  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2266  hypothetical protein  36.22 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0142951  hitchhiker  0.00561226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  51.02 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  40.74 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  41.18 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  52.63 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4235  hypothetical protein  34.55 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0599  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  33.33 
 
 		 64 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  35.71 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2543  hypothetical protein  34.48 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3930  protein of unknown function DUF397  38.89 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  39.62 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2208  hypothetical protein  42.22 
 
 		 61 aa  40.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280221  normal  0.523605 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4137  protein of unknown function DUF397  40 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1543  protein of unknown function DUF397  43.75 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  37.04 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  45.24 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  40.82 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1090  protein of unknown function DUF397  42 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  36.73 
 
 		 61 aa  40  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  39.62 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>