63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0313 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  55.22 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  47.09 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  47.55 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  43.5 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  46.5 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  43.84 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  41.4 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  50.34 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.02 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  45.67 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  41.44 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  40 
 
 		 218 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 		 222 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.5 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.5 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  43.65 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.5 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  34.6 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.06 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.69 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.74 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  34.97 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  41.5 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.8 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  34.83 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.07 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  29.95 
 
 		 226 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.83 
 
 		 255 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.6 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  32.07 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  28.08 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  28.57 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.17 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.06 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  29.35 
 
 		 484 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  28 
 
 		 490 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.53 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.9 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  29.56 
 
 		 484 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.19 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.09 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  27.81 
 
 		 479 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  32.09 
 
 		 492 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.71 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.8 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  23.66 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.91 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.21 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.6 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  25.49 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.45 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  27.62 
 
 		 314 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.4 
 
 		 236 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.09 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>