60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3568 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  94.93 
 
 		 217 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  79.17 
 
 		 217 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  71.83 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.99 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.99 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.62 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  51.44 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.29 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  39.02 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  33.17 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.04 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  35.96 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  35.68 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  37.66 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  34.31 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.34 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  33 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.67 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  29.8 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  34.55 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.26 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.91 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  33.51 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  34.84 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  28.87 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  32.24 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.2 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  27.04 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.17 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  27.04 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  33.5 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  32.5 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  33.5 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  35.94 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  28.26 
 
 		 492 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  31.74 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  29.74 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  24.12 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  22.58 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  23.64 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  26.71 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.64 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  29.67 
 
 		 479 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  25.3 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  28.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.78 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.85 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.3 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.93 
 
 		 344 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.34 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  29.55 
 
 		 484 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  23.59 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.08 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.47 
 
 		 343 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.04 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.81 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>