49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1009 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  64.45 
 
 		 225 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  79.44 
 
 		 223 aa  271  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  69.72 
 
 		 233 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  83.33 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  67.65 
 
 		 230 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  67 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  43.84 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  38.76 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  43.43 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  43.78 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  42.79 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  43.22 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  49.24 
 
 		 208 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  43.22 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  41.38 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.16 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.16 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  37.98 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  34.65 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.49 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.5 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  33.85 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.8 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.92 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.8 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  34.57 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.67 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.99 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.1 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.09 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.4 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.16 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.82 
 
 		 255 aa  78.2  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.88 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.56 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.01 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.62 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.19 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.93 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.79 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.29 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  30.26 
 
 		 379 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0845  peptidase M19 renal dipeptidase  25.67 
 
 		 390 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.773406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>