83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3675 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.77 
 
 		 217 aa  318  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  71.83 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  68.22 
 
 		 217 aa  284  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.2 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.41 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  55.41 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.15 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.67 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  35 
 
 		 210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  34.5 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.73 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  32.8 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  31.03 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  32.99 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.39 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  34.43 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.74 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.68 
 
 		 213 aa  88.2  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  37.19 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  32.99 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.85 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.16 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.52 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  34.73 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  36.18 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  32.46 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.94 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  36.5 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.72 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  27.67 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  27.51 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  35 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  24.02 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.84 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  22.89 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  24.17 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  30.77 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  31.22 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  31.22 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  30.65 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  24.74 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  29.02 
 
 		 492 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2096  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.53 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.4 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  30.34 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.27 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  27.66 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  29.33 
 
 		 479 aa  52.8  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.7 
 
 		 343 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.75 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.42 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.57 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.59 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.63 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  31.9 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.93 
 
 		 206 aa  45.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.31 
 
 		 344 aa  45.4  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  31.03 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  26.9 
 
 		 494 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.85 
 
 		 379 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  32 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  23.42 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.01 
 
 		 353 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.15 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.16 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  31.76 
 
 		 490 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.14 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.87 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.99 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  29.03 
 
 		 484 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.31 
 
 		 204 aa  42  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1417  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 		 208 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.94 
 
 		 212 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 		 210 aa  42  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.56 
 
 		 204 aa  42  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.49 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.07 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>