45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4774 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  66.67 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  69.91 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  65.52 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  68.06 
 
 		 219 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  68.11 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  68.89 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  43.9 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  39.8 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  41.01 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  46.85 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  43.07 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  39.05 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  38.73 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  37.87 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  37.28 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  36.19 
 
 		 216 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.85 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.37 
 
 		 225 aa  89.4  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 		 221 aa  88.6  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  34.05 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.8 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.54 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  35.64 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.43 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.86 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  30.93 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.82 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.07 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  31.31 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  31.41 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.56 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.1 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.53 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.65 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  21.94 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.18 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.55 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>