46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4472 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 223 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  87.89 
 
 		 223 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  81.69 
 
 		 219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  71.23 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  68 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  64.42 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  67.33 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  42.65 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  39.3 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  44.57 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  46.84 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  47.37 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  39.29 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  45.5 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  39.22 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  39.62 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  36 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.35 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  35.08 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  34.22 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  35.64 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.64 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.62 
 
 		 216 aa  89.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.81 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.66 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.66 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.02 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.88 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.71 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  32.99 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.33 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.14 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.65 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.86 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.27 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.19 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.02 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.87 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  30.28 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.98 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>