62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6005 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 230 aa  430  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  79.9 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  55.34 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  56.36 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  56.36 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  55.76 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  45.1 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  44.69 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  44.44 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  43.89 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  45.12 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  47.31 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  41.5 
 
 		 210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  46.54 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  41.58 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.68 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  43.72 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.61 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.87 
 
 		 217 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.79 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.29 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.71 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.38 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.32 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.04 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.18 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  35.27 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  35.5 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  31.53 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  32.71 
 
 		 203 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  32.5 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.5 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  33.66 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  34.85 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.34 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  28.28 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.53 
 
 		 352 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.51 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.62 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1406  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.38 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.67 
 
 		 343 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.06 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.59 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  32.26 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  32.07 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.69 
 
 		 344 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.88 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  29.3 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 		 202 aa  42.4  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.82 
 
 		 218 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30 
 
 		 212 aa  42  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.93 
 
 		 224 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.4 
 
 		 204 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2484  Thiamine-phosphate diphosphorylase  41.13 
 
 		 230 aa  41.6  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.336638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>