46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4318 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 223 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  87.89 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  77 
 
 		 219 aa  294  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  66.81 
 
 		 233 aa  266  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  67.16 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  66.83 
 
 		 230 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  63.46 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  42.16 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  40.8 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  41.57 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  48.05 
 
 		 208 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  46.15 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  40.37 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  38.83 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  39.75 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  43.96 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  36 
 
 		 210 aa  99  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  35.52 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.84 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  34.9 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  37.89 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.3 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  34.76 
 
 		 209 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.86 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 		 219 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.69 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.99 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.01 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.46 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.61 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.89 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.2 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  32.45 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.5 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.35 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.46 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.06 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.32 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  28.78 
 
 		 204 aa  42  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>